Во вселенной Marvel Comics мутанты, люди с генетически заложенными сверхспособностями, подвергаются преследованиям со стороны ненавидящего и боящегося населения. Одним из убежищ от этого является Академия профессора Ксавьера для одаренных детей. Но у школы есть секретная функция - это учебный центр для мутантов, где они учатся контролировать свои способности, чтобы иметь возможность функционировать в обычном обществе. Она также служит секретной штаб-квартирой команды супергероев под названием Люди Икс, созданной как для того, чтобы служить положительным примером мутантов, так и в качестве противостоящей силы против тех мутантов, которые стремятся заставить мир склониться перед их мнимым превосходством. В этом сериале рассказывается об их приключениях, когда они изо всех сил пытаются заставить мир принять их, сражаясь с такими злодеями, как Магнето, Апокалипсис и геноцидными роботами, известными как Стражи.