Нью-Йорк стал домом для криминального авторитета Шреддера и его злобных сообщников, таких как гений Бакстер Стокман и банда жестоких уличных панков Хуна "Пурпурные драконы". После пятнадцати лет жизни и тренировок в безопасном укрытии канализации пришло время Леонардо, Донателло, Рафаэлю и Микеланджело выйти на поверхность и сразиться с этими угрозами городу. С помощью своего сэнсэя, мастера Слинтера, и других союзников, таких как Эйприл О'Нил и Кейси Джонс, четверым зеленым братьям предстоит борьба всей их жизни, если они хотят победить своего заклятого врага.