Игрок может играть за всех пятерых черепах (Леонардо, Донателло, Микеланджело, Рафаэль и Венера де Мило) на пяти уровнях, каждый из которых нужно успеть пройти за 99 секунд.

Выбрав черепаху, игрок должен играть ею на протяжении всей игры без возможности сменить черепаху. У игрока есть полоска жизни и три дополнительные жизни. Когда заканчиваются жизни или истекает время, игра заканчивается. В качестве бонусов можно использовать пиццу для восстановления здоровья и сюрикены для легкой победы над врагами и боссами.

На первом уровне в качестве врагов выступают ниндзя клана Фет, а боссом - Шреддер.

На уровне этапе нужно управлять Хаммером черепах, избегая препятствий и врагов.

На третьем уровне в качестве врагов выступают драконы, а заканчивается он битвой с Бонестилом, где игрок не может нанести ему урон, а должен был уворачиваться от его атак.

На четвертом уровне опять предстоят гонки на Хаммере.

На пятом и последнем уровне в качестве врагов выступают драконы, а в конце предстоит битва с Бонестилом, в которой игроком необходимо победить его, а финальный бой - Повелитель Драконов.