В отличие от Batman: Rise of Sin Tzu на консольных платформах, версия для GBA представляет собой 2D платформер/beat'em up. Игрок управляет Бэтменом, одним из главных героев вселенной DC Comics. Бэтмен бегает по различным районам Готэма, прыгает по крышам и сражается с преступниками. Наш герой может использовать свои кулаки, гаджеты или тяжелые предметы, на которые он может случайно наткнуться, чтобы обезвредить своих врагов. Во время бега будет много препятствий в жанре платформера, например, нужно будет взаимодействовать с рычагами, чтобы перейти на следующие участки. Главный злодей по сюжету - Син Цзы, но Бэтмен встречает и других злодеев из вселенной, например, Пугало.

С помощью соединительного кабеля между Gamecube и Game Boy Advance можно получить разблокируемые предметы как в консольной, так и в портативной версии этой игры.